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ARS scientists adapt DNA test to sugarbeet fungal pathogens
Científicos adaptan ensayo DNA a patógenos de remolacha azucarera
ARS News Service
Agricultural Research Service, USDA
Ben Hardin, (309) 681-6597, bhardin@asrr.arsusda.gov
August 31, 1999

Sugarbeet growers may soon get a new tool for identifying fungi poised to damage their crop. With the same basic technology used in diagnosing human disease, Agricultural Research Service scientists developed a way to quickly identify any of six major fungi types that attack U.S. sugarbeets. Each disease can cause multimillion-dollar losses.

Developed at ARS' Red River Valley Agricultural Research Center, Fargo, N.D., the diagnostic process can be completed within 8 hours. Researchers designed DNA probes that detect unique DNA segments for each fungal type.

Using polymerase chain reaction (PCR), the scientists reproduce millions of copies of unique segments occurring in a plant tissue sample harboring fungi. From the amplified DNA, they can quickly distinguish pathogens by a "DNA fingerprint" generated when DNA is cut into pieces with an enzyme.

With PCR, scientists don't have to isolate fungi from diseased roots or leaves and spend days culturing them before they're identified. Rapid identification of offending microbes by their DNA would tip off growers to the need for applying the most appropriate control measures before diseases seriously curtail yields.

Further research aims at narrowing the fungi's identification by species as well as genus. The scientists have already developed probes to distinguish Aphanomyces cochlioides, which causes black root disease of sugarbeet, from A. euteiches, which causes root rot in peas and other legumes. Other sugarbeet fungi include Pythium ultimum, Cercospora beticola, Phoma betae,
Fusarium oxysporum and Rhizoctonia solani.

Another goal is to use the technology to analyze fungi in field soils as well as plant samples. By knowing soil infestation levels, farmers could better decide when and where to rotate crops.

ARS is USDA's chief research agency.

Scientific contact:

John J. Weiland, Sugarbeet and Potato Research, ARS Red River Valley Agricultural Research Center, Fargo, N.D., phone (701) 239-1373; fax (701) 239-1349, weilandj@fargo.ars.usda.gov.


Científicos adaptan ensayo DNA a patógenos de remolacha azucarera

Servicio Noticiero del Servicio de Investigación Agrícola (ARS siglas en inglés)
Departamento de Agricultura (USDA siglas en ingles)
Ben Hardin, (309) 681-6597, bhardin@asrr.arsusda.gov
31 de agosto 1999

Cultivadores de remolacha azucarera, pronto recibirán una herramienta nueva para identificar el fungo cual daña sus siembras. Con la tecnología basica usado en diagnosticando enfermedades humanos, científicos del Servicio de Investigación Agrícola (ARS siglas en inglés) han desarrallado una manera para identificar con rapidez cualquier de las seis tipos mayores de fungo que atacan la remolacha azucarera en los Estados Unidos. Cada enfermedad puede causar multimillones de dolares en pérdidas.

Desarrollado en el Centro de Investigación Agrícola del Valle de Río Rojo en Fargo, North Dakota, el método diagnostico puede estar completado entre 8 horas. El método usa el DNA, cual es la aterial genética de todos los organismos. Investigadores diseñaron tientas de DNA para detectar
segmentos únicos de DNA para cada tipo de fungo.

Usando una tecnología llamada ‘Polymerase Chain Reaction' (PCR siglas en inglés), los científicos reproducen millones de copias de los segmentos únicos occuriendo en una muestra de tejido de mata cual tiene el fungo. De un DNA amplificado, ellos pueden distinguir con rapidez los patógenos por una ‘huella digital" de DNA, generado cuando el DNA está cortado con una
enzima.

Con PCR, científicos no tienen que aislar el fungo de las raíces o hojas que están enfermas y gastar tiempo en cultivandolos antes que estén identificados. Con la rapidez de la identificación de estos microbios por su DNA, le daria a los cultivadores una señal para aplicar las medidas
adecuadas del control antes que la enfermedad dañe los reditos.

Investigaciónes en el futuro apuntaran sobre identificando el fungo por especie y género. Los científicos ya han desarrollado tientas para distinguir sobre los patógenos ‘Aphanomyces cochlioides' y ‘Aphanomyces Euteiches'. Otros patógenos de la remolacha azucarera son ‘Phythium ultimum', Cercospora beticola', Phoma betae', ‘Fusarium oxysporum', y ‘Rhizoctonia solani'.

Otro gol es para usar la tecnología para analizar el fungo en las tierras de campos así como en las muestras de matas. En conociendo los niveles de infestación en la tierra, cultivadores podran determinar mejor cuando y donde deben de cambiar las siembras.

ARS es la agencia principal de investigación del Departamento de Agricultura.

Contacto científico:

John J. Weiland, Sugarbeet and Potato Research, ARS Red River Valley Agricultural Research Center, Fargo, N.D., teléfono (701) 239-1373; fax (701) 239-1349, weilandj@fargo.ars.usda.gov.

USDA news release
N2084

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